El sistema hidrográfico del Departamento de Loreto, esta constituido por una red de caudalosos y pequeños ríos, riachuelos y quebradas que van a confluir en cinco vertientes formada por los ríos Ucayali, Huallaga, Marañón, Napo y Yavarí, los que a su vez van a confluir en la gran cuenca del río Amazonas, llamado r¡o mar. El Amazonas constituye la cuenca fluvial navegable más grande del mundo y la de mayor caudal, habitada por una rica flora y fauna acuática silvestre. Los lechos fluviales que son muy amplios, tienen ausencia de cantos rodados, exceptuando el Alto Ucayali y sus afluentes, así como el curso alto de algunos ríos del suroeste que nacen en la Selva Alta. La característica predominante de los lechos fluviales es la existencia de extensas playas en las orillas convexas de los meandros. Estas playas son utilizadas para el cultivo de plantas como el arroz, maní y otras que tienen rápido crecimiento y cosecha.Río AmazonasQue tiene sus or¡genes en las nacientes más lejanas del Ucayali-Apur¡mac, que están localizadas al norte del departamento de Arequipa, en el Nevado de Mismi, a 5597m. de altitud y 15º30'49" longitud Oeste.La longitud del Ucayali-Amazonas en el Perú, es de aproximadamente 3762 Km. y llega, hasta su desembocadura a los 6762 Km., que ser¡a el más largo del mundo. Toma el nombre de Amazonas, desde la confluencia de los r¡os Marañón y Ucayali, cerca de la ciudad de Nauta, localizada en la margen izquierda del r¡o Marañón.El Amazonas tiene un lecho muy sinuoso con numerosas curvasque son amplios meandros de gran radio y que evolucionan constantemente. El volumen de sus aguas es muy importante ysu ancho entre riberas es de 4 kilómetros en la confluencia del Ucayali y Marañón, luego fluctúa entre 2 y 5 Km. La velocidad de sus aguas es de 4 Km/hora frente a Iquitos y su profundidad var¡a entre 10 y 30 metros. Su lecho mayor de inundación es muy amplio y en algunos sectores abarca decenas de Km. El fondo de su lecho es móvil y está constituido esencialmente por arena y limo. Durante el estiaje quedan al descubierto extensas playas que son cultivadas. La erosión en las riberas es fenómeno generalizado y en algunos sectores alcanza gran intensidad como en el caso de Iquitos.
El principal afluente del Amazonas en suelo loretano es el r¡o Napo, que naciendo en Ecuador delimita el territorio peruano desde su confluencia con el r¡o Yasuni por la margen derecha y a partir de su confluencia con el Aguarico, penetra ya en las tierras de Loreto. Desemboca en el Amazonas, margen izquierda, junto a la poblaci¢n de Francisco de Orellana. El ancho del r¡o Napo var¡a de 1.5 a 3.0 Km.Dos ríos importantes que recorren Loreto son los formadores del río Amazonas:Ucayali y Marañón,que con sus afluentes drenan aproximadamente las dos terceras partes de la superficie de Loreto.Otros afluentes importantes del r¡o Amazonas en el departamento de Loreto son los r¡os Nanay, Itaya, Campiyacu, por la margen izquierda; por la margen derecha, los r¡os Cochiquinas y Yavari.El Río YavaríQue sirve de l¡mite al Perú con el Brasil a lo largo de todo su recorrido, es un río de curso muy sinuoso y con una longitud superior a los 1000 Km. Sus mayores afluentes son los ríos Gálvez y Yavarí-Mirin.El Río PutumayoSirve de límite al Perú con Colombia; desde su confluencia con el río Goeppi hasta la desembocadura del río Yaguas. Penetra luego a territorio colombiano y después al de Brasil, para dar sus aguas al Amazonas en jurisdicción de este último pa¡s.El Río UcayaliTiene su nacientes en los or¡genes del río Apur¡mac,que están en el nevado del Mismi a 5597 m.s.n.m.,provincia de Cailloma departamento de Arequipa. Toma el nombre de Ucayali, en la confluencia del río Tambo con las aguas del r¡o Urubamba.El Ucayali tiene un lecho muy sinuoso y con meandros que se suceden continuamente. El Alto Ucayali, aguas arriba de la desembocadura del río Pachitea, se caracteriza por la velocidad de sus aguas y la existencia de altas terrazas no inundables.En el bajo Ucayali, al norte de la confluencia con el río Pachitea se acentúa la sinuosidad de su lecho que tiene grandes playas o arenales, con ausencia total de cantos rodados.La erosión en sus riberas es intensa, igual que la divagancia de su lecho. Tiene numerosos afluentes, siendo los mayores: Pachitea, Aguaytía y Pisqui, por la margen izquierda; y los r¡os Tamaya, Abujao y Tapichi, por la margen derecha. Estos últimos, tienen una gran riqueza ictiológica, siendo el paiche el pez que más abunda y cuyo consumo es tradicional.El Ucayali es navegable desde Atalaya, ubicado en la confluencia del Tambo, con el Urubamba. El principal puerto es Pucallpa.Otros son: Masisea, Contamana y Requena.A orillas del Ucayali existen numerosos centros poblados y fundos agropecuarios.El Río MarañónTiene sus or¡genes en el Nevado de Yarupa a 5800 m.s.n.m., penetra en el departamento de Loreto después de atravesar el gran cañón fluvial conocido con el nombre de Pongo de Manseriche.
Afluentes importantes del Marañón en territorio de Loreto son los r¡os: Morona, Pastaza y Tigre, que le dan sus aguas por la margen izquierda; por la margen derecha el río Huallaga.Entre los principales lagos y lagunas de la región Loreto están:Lago Rimachi, situado en la margen derecha del río Pastaza, con una superficie de 79 Km y es de origen fluvial pues parece que en el pasado ha sido cauce del río Pastaza o del Marañón. Las aguas del Lago Rimachi son limpias y transparentes y esta densamente poblado por una gran variedad de peces ornamentales y fauna fluvial amazónica en general.La Laguna Pavayacu, situada en la margen derecha del r¡o Marañón, al sur de la desembocadura del r¡o Pastaza. Tiene 10 Km. de longitud y es de origen fluvial, formándose en cauce abandonado del río Marañón. Esta poblado de abundante fauna silvestre y desagua en el río Huallaga.La Laguna Quistococha, cerca de Iquitos de 210 Km y formado por el cauce abandonado del río Amazonas. En el se ha establecido un criadero de paiches y sirve como lugar de recreación para la población de Iquitos y los turistas.
Afluentes importantes del Marañón en territorio de Loreto son los r¡os: Morona, Pastaza y Tigre, que le dan sus aguas por la margen izquierda; por la margen derecha el río Huallaga.Entre los principales lagos y lagunas de la región Loreto están:Lago Rimachi, situado en la margen derecha del río Pastaza, con una superficie de 79 Km y es de origen fluvial pues parece que en el pasado ha sido cauce del río Pastaza o del Marañón. Las aguas del Lago Rimachi son limpias y transparentes y esta densamente poblado por una gran variedad de peces ornamentales y fauna fluvial amazónica en general.La Laguna Pavayacu, situada en la margen derecha del r¡o Marañón, al sur de la desembocadura del r¡o Pastaza. Tiene 10 Km. de longitud y es de origen fluvial, formándose en cauce abandonado del río Marañón. Esta poblado de abundante fauna silvestre y desagua en el río Huallaga.La Laguna Quistococha, cerca de Iquitos de 210 Km y formado por el cauce abandonado del río Amazonas. En el se ha establecido un criadero de paiches y sirve como lugar de recreación para la población de Iquitos y los turistas.
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